当患者得了巧克力囊肿，可根据具体情况进行治疗。对于症状较轻、有生育要求的女性，可采取药物治疗的方式进行治疗，而对于症状严重、没有生育要求的女性，可进行手术治疗。

一、药物治疗：

1、口服药物：临床上常用的治疗巧克力囊肿的药物为短效避孕药，如去氧孕烯炔雌醇片、屈螺酮炔雌醇片等，上述药物可抑制卵巢功能，使子宫内膜变薄，阻止子宫内膜异位症的发展。此外，还可应用地诺孕素片等药物进行治疗，但通常不建议长期服用;

2、注射药物：如醋酸曲普瑞林注射液等，药物可抑制垂体分泌促性腺激素，使卵巢分泌的性激素减少，继而缩小卵巢囊肿，缓解巧克力囊肿导致的痛经、月经不调等症状;

3、皮下注射药物：如醋酸戈舍瑞林缓释植入剂等，注射后可促使子宫内膜萎缩，从而缩小巧克力囊肿的范围;

4、其他药物：如醋酸甲羟孕酮片等，可使子宫内膜变薄，阻止子宫内膜异位症的发展，缓解巧克力囊肿。

二、手术治疗：

对于症状严重、没有生育要求的女性，可进行手术治疗。通过手术将卵巢囊肿切除，但对于存在生育要求的女性，在手术过程中，需尽量保护卵巢功能，否则可能会影响怀孕。

临床上可通过腹腔镜手术与开腹手术，治疗巧克力囊肿。对于未婚、有生育要求的女性，建议进行子宫及双侧附件切除术。但对于存在恶性肿瘤、严重心血管疾病等的人群，不建议进行手术治疗。